Chaos-Control ist tatsächlich auf der Erde ausgebrochen. Doch entgegen aller Erwartungen sind nicht alle, die unmittelbar davon betroffen waren, auf Sonics Heimatplaneten gelandet. Trotzdem ist längst nicht alles in Ordnung. Denn Sonic ist seit dem Vorfall verschwunden und so machen sich Chris, Tails, Cream, Cheese und Chuck große Sorgen.
28. Ein chaotischer Tag (A Chaotic Day)
Als Knuckles auf der fliegenden Insel ankommt, findet er nur noch einen Rest des Master Emerald und diese seltsame Gestalt von Eggman, die wohl den Master Emerald im Auftrag des Wissenschaftlers zerstört hat. Außerdem berichtet Big den Freunden von seinem Erlebnis mit dem schleimigen Etwas, das Froggy verschwinden ließ.
29. Aufstand des Roboters (A Robot Rebels)
Während Eggman seine neue Generation Roboter fertig stellt und einsatzbereit macht, halten die Freunde Kriegsrat, wie sie der armen Amy helfen können. Der Plan: Während Sonic und Tails versuchen, auf Eggmans Schiff zu gelangen, übernehmen Chuck, Cream und Cheese die Bodenüberwachung. Außerdem machen sich Chris und Big auf die Suche nach Froggy.
30. Kopf hoch, Tails! (Head's up, Tails!)
Es gelingt Sonic, Tails und Knuckles tatsächlich, auf Eggmans Schiff zu landen. Knuckles will dort nach den Resten des Master-Emeralds und Sonic nach Amy suchen. Tikal holt Knuckles wieder zurück in ihre Zeit, um ihn das Schicksal seines Stammes zu zeigen. Chris hingegen kann mit Big flüchten, wird aber von Chaos gefangen genommen.
31. Die Rache des Roboters (Revenge Of The Robot)
Beinahe hätte Eggman Station Square zerstört, doch Dank seines technischen Wissens konnte Tails die Bombe entschärfen. Er wird nun in der Stadt als Held gefeiert, macht sich aber nichts daraus. Er will sich erneut auf die Suche nach Chaos Emeralds machen, und da ist der Rummel um seine Person nur hinderlich.
32. Die Wasserschlacht (Flood Fight)
Knuckles und Sonic erfahren, dass Chaos nur noch einen Emerald braucht, um unbesiegbar zu werden. Als sie auf Tikal treffen, erzählt sie den beiden das Geheimnis des Master Emeralds und warum Chaos überhaupt freigesetzt wurde. Es kommt nach Chaos' perfekten Verwandlung zu einen Kampf zwischen den positiven und den negativen Nutzen der Chaos Emeralds.